کلرهگزیدین یکی از دهانشویه های پرمصرف است که در دندانپزشکی برای درمان عفونت های دهان زخم های دهان و لثه به کار می رود. کلرهگزیدین بر طیف وسیعی از باکتری های گرم مثبت و منفی و همچنین برخی از قارچ‌ ها و برخی از ویروس‌ ها از جمله ویروس مولد ایدز و هپاتیت مؤثر است. کلرهگزیدین به صورت محلول موضعی کاربردهای غیردهانی نیز دارد. کلرهگزیدین به شدت خاصیت کاتیونی دارد و به سه فرم دی‌گلوکونات، استات و هیدروکلرید موجود است که دو فرم دی‌ گلوکونات و استات قابل حل در آب هستند.