کتوکونازول از جمله داروهایی است که برای از بین بردن عفونت‌ های قارچی تجویز می شود. این ضد قارچ  معمولا در درمان کچلی و همچنین عفونت‌ های قارچی ناخن استفاده می‌شود. از این دارو به منظور درمان سرطان پروستات و درمان کاندیدیازیس واژن و عفونت‌های قارچی سیستم مرکزی عصبی (CNS) هم استفاده می‌شود. علاوه بر این شامپو کتوکونازول در کنترل شوره سر مفید است. این دارو به سه شکل قرص، شامپو و کرم موجود می‌باشد.